Un Web d'analyse scientométrique basée sur la science de la cible mammifère d'une voie de signalisation de la rapamycine dans les maladies rénales de 1986 à 2020 Partie 1

Examen des auteurs et de la littérature marquants 

A total of 14,045 researchers had published the 2,585 manuscripts and the number of authors in every paper on average was 5.43. We used CiteSpace and VOSviewer to analyze co-authorship and citation networks among authors and to reveal the most highly cited researchers and collaboration among researchers. "Key researcher" was referred to as someone whose literature had been cited more than 500 times (global citation score >500). Les nœuds indiquaient différents chercheurs. Les lignes entre les nœuds représentaient la coopération entre les auteurs, et la taille du nœud indiquait le nombre d'articles publiés par l'auteur (Figure 3C, D). Linehan WM, Schmidt LS, Sommerer C, Kasinath BS, Aburatani H et Baba M ont apporté des contributions exceptionnelles à la recherche de la voie de signalisation mTOR dansmaladie du rein. Linehan WM a publié 24 articles dans ce domaine de recherche. Linehan WM, Schmidt LS et Huber TB, qui peuvent être considérés comme les leaders de ce domaine de recherche, ont chacun reçu plus de 1 000 citations. Linehan WM et Aburatani H ont collaboré à de nombreux articles, mais leur coopération avec Kwiatkowski DJ n'a pas été aussi fréquente (Figure 3D). Les 2 585 types de littérature sur les voies de signalisation mTOR dansmaladie du reinont également cité les uns les autres ou quelques autres études dans leurs références. Nous avons utilisé CiteSpace pour analyser 71 544 références de leurs compositions et produire les 20 rafales de citations les plus fortes et un réseau de co-citation rationalisé (Figure 3E, F). Le chiffre des citations de ces publications a soudainement augmenté pendant un laps de temps, ce qui a révélé l'acceptation et la diffusion rapides dans les domaines spécifiques de la recherche et a occupé des positions très importantes dans le cadre des connaissances.

Visualisation des mots-clés et des termes MeSH

La fréquence d'occurrence et la tendance temporelle des mots-clés et des termes MeSH ont été visualisées par le programme de CiteSpace et VOSviewer. Afin d'extraire les concepts clés du mTOR dansmaladie du rein, nous avons utilisé le système Carrot2 pour analyser les sujets majeurs. Il y avait les 6 premiers mots-clés dans le cadre rouge, qui représentaient le taux d'occurrence le plus élevé avec "Recipients Transplanted", "Investigated the Effects ofmTOR", "Akt Expression", "Target Genes", "Mammalian Target of Rapamycin Signaling" et "Therapy to a Mammalian Target of Rapamycin" (Figure 4A). Sur la base de CiteSpace, le réseau de co-citation a été segmenté en différents clusters à partir des titres des articles cités (figure 4B).La visualisation du réseau des mots-clés et l'enquête de regroupement de mTOR étaient basées sur le programme VOSviewer (figure 4C, D).

Le logiciel de CiteSpace a été utilisé pour analyser la vue du fuseau horaire et une vue chronologique de lamTORvoie de signalisation dans lemaladie du reinréseau de co-citation. L'heure de publication a été révélée en haut de la vue. Le chiffre des nœuds dans une ligne horizontale représentait l'importance du domaine d'étude et le lien entre les nœuds reflétés citant. La vue chronologique a également montré l'occurrence, la popularité et le déclin des sujets de recherche dans les publications les plus typiques.

Figure 4La visualisation des mots-clés et des termes MeSH. (A) L'analyse des mots-clés pour la voie de signalisation mTOR dans les maladies rénales. (B) L'analyse de regroupement du réseau de co-citation pour la voie de signalisation mTOR dans les maladies rénales. (C) La visualisation du réseau de mots-clés. (D) Carte thermique des mots-clés.

Pendant ce temps, les clusters reflétaient les caractéristiques temporelles des domaines de recherche dans la vue chronologique. Le développement du cluster 10 (binding protein) a montré l'exploration précoce de la voie mTOR dansreinla recherche se concentrant sur la protéine de liaison, qui s'est produite le plus tôt. Grappe 0 (transplantation rénale), groupe 1 (maladie polykystique autosomique dominantemaladie du rein), le groupe 4 (carcinome à cellules rénales), le groupe 5 (néphropathie diabétique), le groupe 7 (angiomyolipome rénal) et le groupe 13 (maladies non glycémiques) étaient les frontières et les axes de recherche actuels (figure 5A). Les résultats de l'analyse de la chronologie des mots clés ont révélé un inhibiteur de la calcineurine, une néphropathie diabétique, une polykystose autosomique dominante.maladie du rein,et complexe de sclérose tubéreuse (figure 5B). Les recherches actuelles portent sur le mécanisme et les complications demaladie du rein. La vue du fuseau horaire des nœuds de cluster a été illustrée lorsque le réseau de co-citation a cité des publications, ce qui pourrait également démontrer clairement les progrès de la recherche au fil du temps (figure 5C). Et la connexion centrale entre les fuseaux horaires révélait à quel point le message manquait ou était reconnu pour stimuler les révélations et favoriser les investigations. S'il y avait plus de types de littérature dans une visualisation de fuseau horaire, ce serait une période significative (Figure 5C).

L'analyse à double carte a été utilisée pour indiquer et générer des connexions et des contributions scientifiques. Le contour citant est sur la moitié gauche et le contour cité est sur la moitié droite. La ligne d'association de citations dans la trajectoire d'une région à une autre illustrerait la compréhension des relations inter-spécialités, favorisant ainsi les connexions et la connaissance des différents domaines de recherche (figure 5D).

Figure 5Affichage du fuseau horaire des nœuds du cluster et visualisation chronologique des mots-clés et des termes MeSH. (A) La visualisation de la chronologie du terme de 1986 à 2020. (B) La visualisation de la chronologie des mots-clés de 1986 à 2020. (C) La visualisation de la vue du fuseau horaire des nœuds du cluster. (D) Superpositions à double carte de publications sur mTOR dans les maladies rénales.

Discussion 

Contrairement aux revues traditionnelles, l'analyse bibliométrique peut traiter systématiquement des manuscrits dans des domaines de recherche connexes afin d'obtenir des résultats plus intuitifs et clairs. Pour les nouveaux chercheurs dans des domaines spécifiques, il peut être utile de suivre les axes d'étude actuels et les tendances générales et de révéler des types de littérature marquants dans le domaine. De plus, il est facile et convivial d'utiliser le logiciel d'analyse bibliométrique actuel. Dans la recherche actuelle, nous avons présenté une analyse bibliométrique concernant la voie de signalisation mTOR dansmaladie du rein.

Selon des études pertinentes, ces dernières années, la recherche sur l'utilisation de cellules souches et d'un remède à base de plantes chinoises pour le traitement demaladies rénalesa attiré une grande attention. Le principal mécanisme des deux thérapies est de favoriser la réparation des tissus rénaux lésés etprotéger les fonctions rénales restantes.

Le remède chinois à base de plantes,cistanche, a été utilisé en médecine traditionnelle chinoise pour traiter diverses affections chroniquesmaladies rénalesdepuis les temps anciens. Il est rapporté quecistanchea le potentiel de réduire l'inflammation,réduire la fibrose rénale, et favorisent la synthèse des composants de la matrice extracellulaire. Il a été révélé que ces effets sont dus à ses composants bioactifs, notamment de nombreuses substances phénoliques, des triterpénoïdes et des coumarines.

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D'autre part, la technologie des cellules souches a provoqué une révolution dans la pratique médicale. La recherche a démontré que les cellules souches peuvent se différencier en divers types de cellules rénales et exercer des activités thérapeutiques, notamment en protégeant les tissus rénaux fonctionnels restants, en ralentissant la fibrose tissulaire et en réparant les tissus rénaux endommagés.

En fin de compte, la combinaison de la médecine traditionnelle chinoise avec la science moderne pourrait être la clé du traitement de diversmaladies rénales.Cette stratégie a été progressivement acceptée par la communauté médicale et des études ont déjà montré que la thérapie combinée du cistanche et du traitement par cellules souches pouvait réduire considérablement le taux de mortalité desmaladies rénales. 

En conclusion, l'utilisation du cistanche et du traitement par cellules souches dans le traitement desmaladies rénalesmontre un grand potentiel et nécessite des recherches supplémentaires. La thérapie combinée des deux traitements pourrait fournir une option de traitement améliorée pour les personnes confrontées àmaladies rénales.

Sur la base des résultats, un total de 2 585 types de littérature avec 71 544 références ont été extraits de WoSCC. Le chiffre des manuscrits augmente chaque année. Bien que la voie de signalisation mTOR soit une branche de la recherche globale dereins, sa tendance à la recherche a progressivement augmenté récemment (Figure 2A). Les États-Unis, la Chine et l'Allemagne sont plus importants dans ce domaine, représentant 55,7 % des publications. Cinq des 20 institutions les plus productives se trouvent aux États-Unis (tableau 1), ce qui montre que la qualité de la littérature publiée par les institutions américaines est supérieure. Les institutions de recherche, telles que l'Université de Harvard (Figure 2F, G, H), sont relativement matures dans ce domaine spécifique et peuvent être considérées comme des institutions importantes pour l'apprentissage et la collaboration. Ces résultats indiquent que les États-Unis occupent leur position de leader dans la voie de signalisation mTOR enmaladie du rein, principalement reflété dans les collaborations internationales, le nombre total de citations et le nombre de publications. Notamment, par rapport à l'Allemagne et à l'Angleterre, les publications d'autres pays européens tels que l'Italie et la Suisse ont considérablement augmenté après 2014, révélant que des pays/régions plus développés se consacreront à des recherches plus approfondies dans ce domaine (Figure 2E).

Les revues d'un même cluster possèdent le même domaine de recherche. En utilisant la fonction du logiciel VOSviewer, nous avons divisé les 100 meilleures revues en trois groupes (Figure 3B). Sur la base de CiteSpace, l'ensemble des domaines de recherche ont été détectés et divisés en quatorze sous-ensembles et les sept plus grands clusters sont affichés sur la figure 4B, y compris le cluster 0 "transplantation rénale", groupe 1 "polykystique autosomique dominantemaladie du rein", cluster 2 "transplantation rénale", cluster 3 "carcinome à cellules rénales", cluster 4 "hamartin", cluster 5 "autophagie" et cluster 6 "complexe de sclérose tubéreuse". Le cluster 3 "carcinome à cellules rénales" indique que mTOR est significatif dans la recherche sur le carcinome à cellules rénales (RCC) et que la propriété antiproliférative des inhibiteurs de mTOR peut inhiber la croissance tumorale. Le RCC se classe respectivement au septième et au neuvième rang chez les hommes et les femmes, et le nombre de nouveaux cas de cancer augmentera à l'avenir (29) . La résection chirurgicale est la principale méthode de traitement des tumeurs confinées au rein. Environ un tiers des patients ont des métastases à distance, et la plupart des cas sont incurables. L'interféron est largement utilisé dans le carcinome à cellules rénales par translocation, mais son efficacité et sa tolérance sont limitées. Par conséquent, de nouvelles cibles thérapeutiques de mTOR entrent en jeu (30,31). Nous avons utilisé CiteSpace pour effectuer une analyse de co-citation et déterminé plusieurs jalons de la littérature (figure 3F). Par exemple, Linehan WM a révélé la base génétique du RCC. et le rôle de la voie mTOR dans sa pathogenèse (32). Hude et al. ont également évalué le temsirolimus, un inhibiteur de mTOR pour le RCC (33). Serra et al. a évalué le sirolimus et la croissance rénale chez les patients polykystiques autosomiques dominants.maladie du rein(34). Les travaux de Laplante et al. a la plus grande rafale de citations (Figure 3F): signalisation mTOR dans le contrôle de la croissance et la maladie (4). Shillingford et al. ont élaboré que l'inhibition de la voie mTOR pourrait inverser la cystogenèse rénale chez les polykystiquesmaladie du rein(35). Le manuscrit a été inclus dans le groupe 1 « polykystose autosomique dominantemaladie du rein" et groupe 5 "autophagie".

Les lecteurs peuvent reconnaître avec autorité le mécanisme de mTOR danstransplantation rénale, le cancer du rein et le complexe de la sclérose tubéreuse rénale, et leur traitementmaladie du reinà travers ces manuscrits marquants. Selon les figures 5A et B, le développement du mTOR dansmaladie du reinsur un temps spécifique est clairement indiqué. L'inhibiteur de la calcineurine est un point chaud de la recherche et les chercheurs ont illustré la comparaison des inhibiteurs de la calcineurine et des inhibiteurs de mTOR pour traitermaladie du rein(13,36,37). De plus, la recherche de la voie de signalisation mTOR dansmaladie du reinpourrait commencer lié à mTOR (38-40). Nous avons utilisé VOSviewer et Carrot2 pour reconnaître les mots-clés importants (Figure 4A, C, D). Parmi les points chauds de la figure 4C, D, il existe plusieurs noms de médicaments, tels que la rapamycine, le sirolimus, l'évérolimus, etc. En 1999, la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis a approuvé la commercialisation de la rapamycine comme nouvelle option de traitement pour prévenir le rejet d'organe chez les receveurs de greffe rénale (41). Par conséquent, la recherche sur la rapamycine est principalement concentrée vers 2000 (figure 4C). En mars 2010, l'évérolimus a obtenu l'approbation de la FDA américaine et de l'Agence européenne des médicaments pour le traitement du RCC avancé et la transplantation rénale (42). Et ainsi, la recherche sur l'évérolimus et la transplantation rénale s'est principalement concentrée sur 2010 (Figure 4C). Nous avons analysé les tendances temporelles des mots-clés par CiteSpace (Figure 5A, B, C). Néphropathie diabétique,transplantation rénale, la polykystose rénale autosomique dominante, le complexe de sclérose tubéreuse, le carcinome à cellules rénales et l'autophagie pourraient être des axes de recherche au cours des prochaines années.

Selon les superpositions à double carte (Figure 5D), la trajectoire de citation nous indique que la médecine et la biologie sont les régions dominantes de la voie de signalisation mTOR dansmaladie du rein, et mTOR a peu de rapport avec d'autres disciplines. Chiew et al. a décrit une plate-forme tridimensionnelle en utilisant un capteur de caspase -3 basé sur le transfert d'énergie par résonance de fluorescence pour détecter la capacité apoptotique des inhibiteurs de mTOR (43). Avec des recherches plus approfondies sur la signalisation mTOR dansmaladie du rein, d'autres sujets seront éventuellement impliqués. Cependant, cette étude présente certaines limites, qui doivent être prises en compte lors de l'analyse des résultats de la recherche. Premièrement, la littérature n'est extraite que de la base de données WoSCC, ce qui pourrait entraîner une récupération incomplète des documents. Deuxièmement, nous avons détecté certains clusters, tels que l'hémangiome du foie et les cellules épithéliales du côlon, qui ne sont pas étroitement liés àmaladie du rein.

conclusion

Les futurs points chauds de la recherche comprendront la néphropathie diabétique,reintransplantation, polykystique autosomique dominantemaladie du rein,complexe de sclérose tubéreuse, carcinome à cellules rénales et autophagie. Basé sur diverses méthodes scientifiques, il peut fournir une direction de recherche future pour ceux qui sont nouveaux dans ce domaine.

Remerciements

Financement : Ce travail a été soutenu par la Fondation nationale des sciences naturelles de Chine (numéro de subvention 81703851).

Les références

1. Aleman JO, Eusebi LH, Ricciardiello L, et al. Mécanismes de la néoplasie gastro-intestinale induite par l'obésité. Gastroentérologie 2014 ; 146 :357-73.

2. D'Agati VD, Chagnac A, de Vries AP, et al. Glomérulopathie liée à l'obésité : caractéristiques cliniques et pathologiques et pathogenèse. Nat Rev Nephrol 2016 ; 12 :453-71.

3. Blandino-Rosano M, Barbaresso R, Jimenez-Palomares M, et al. La perte de signalisation mTORC1 altère l'homéostasie des cellules bêta et le traitement de l'insuline. Nat Commun 2017;8:16014.

4. Laplante M, Sabatini DM. Signalisation mTOR dans le contrôle de la croissance et la maladie. Cellule 2012 ; 149 : 274-93.

5. Li J, Kim SG, Blenis J. Rapamycine : un médicament, de nombreux effets. Cell Metab 2014;19 :373-9.

6. Uno K, Yamada T, Ishigaki Y, et al. Une voie de signalisation dépendante des acides aminés hépatiques/mTOR/S6K module le métabolisme lipidique systémique via des signaux neuronaux. Nat Commun 2015;6:7940.

7. Kim K, Qiang L, Hayden MS, et al. mTORC1- Raptor indépendant prévient la stéatose hépatique en stabilisant PHLPP2. Nat Commun 2016;7:10255.

8. Han J, Li E, Chen L, et al. Le coactivateur CREB CRTC2 contrôle le métabolisme des lipides hépatiques en régulant SREBP1. Nature 2015 ;524 :243-6.

9. Lipton JO, Sahin M. La neurologie de mTOR. Neuron 2014 ;84 :275-91.

10. Bockaert J, Marin P. mTOR en physiologie et pathologies cérébrales. Physiol Rev 2015 ; 95 :1157-87.

11. Crino PB. La cascade de signalisation mTOR : ouvrir de nouvelles voies pour guérir les maladies neurologiques. Nat Rev Neurol 2016 ; 12 :379-92.

12. Ardestani A, Lupse B, Kido Y, et al. Signalisation mTORC1 : une épée à double tranchant dans les cellules bêta diabétiques. Cell Metab 2018 ;27 :314-31.

13. Fantus D, Rogers NM, Grahammer F, et al. Rôles des complexes mTOR dans le rein : implications pour les maladies rénales et la transplantation. Nat Rev Nephrol 2016 ; 12 :587-609.

14. Shiels PG, McGuinness D, Eriksson M, et al. Le rôle de l'épigénétique dans le vieillissement rénal. Nat Rev Nephrol 2017 ; 13 :471-82.

15. Orhon I, Dupont N, Zaidan M, et al. L'autophagie dépendante du cil primaire contrôle le volume des cellules épithéliales en réponse au flux de liquide. Nat Cell Biol 2016;18 :657-67.

16. Grahammer F, Nesterov V, Ahmed A, et al. mTORC2 régule de manière critique la manipulation rénale du potassium. J Clin Invest 2016 ;126 :1773-82.

17. MacKeigan JP, Krueger DA. Différencier les inhibiteurs de mTOR everolimus et sirolimus dans le traitement du complexe de la sclérose tubéreuse. Neuro Oncol 2015 ; 17 :1550-9.

18. Menezes LF, Germino GG. La pathobiologie de la polykystose rénale d'un point de vue métabolique. Nat Rev Nephrol 2019 ; 15 :735-49.

19. Gui Y, Lu Q, Gu M, et al. L'axe fibroblaste mTOR/PPARgamma/HGF protège contre la mort des cellules tubulaires et les lésions rénales aiguës. La mort cellulaire diffère 2019;26 :2774-89.

20. Choueiri TK, Je Y, Sonpavde G, et al. Incidence et risque de mortalité liée au traitement chez les patients cancéreux traités avec la cible mammifère des inhibiteurs de la rapamycine. Ann Oncol 2013 ;24 : 2092-7.

21. Gimpel C, Bergmann C, Bockenhauer D, et al. Déclaration de consensus international sur le diagnostic et la prise en charge de la polykystose rénale autosomique dominante chez les enfants et les jeunes. Nat Rev Nephrol 2019 ; 15 :713-26.

22. Allison SJ. Maladie glomérulaire : mTOR dans la FSGS. Nat Rev Nephrol 2017;13:260.

23. van Eck NJ, Waltman L. Regroupement de publications basé sur les citations utilisant CitNetExplorer et VOSviewer. Scientométrique 2017 ; 111 :1053-70.

24. Chen C, Song M. Visualisation d'un domaine de recherche : une méthodologie de revues scientométriques systématiques. PLoS One 2019;14:e0223994.

25. Schargus M, Kromer R, Druchkiv V, et al. Les 100 meilleurs articles sur la sécheresse oculaire - Une analyse bibliométrique. Ocul Surf 2018 ; 16 :180-90.

26. Sugimoto CR, Ahn YY, Smith E, et al. Facteurs affectant le signalement lié au sexe dans la recherche médicale : une analyse bibliométrique interdisciplinaire. Lancet 2019;393 :550-9.

27. Fedewa MV, Hathaway ED, Ward-Ritacco CL. Effet de l'entraînement physique sur la protéine C réactive : une revue systématique et une méta-analyse d'essais contrôlés randomisés et non randomisés. Br J Sports Med 2017 ; 51 :670-6.

28. Yu L, McPhee CK, Zheng L, et al. Arrêt de l'autophagie et reformation des lysosomes régulés par mTOR. Nature 2010 ;465 :942-6.

29. Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Statistiques sur le cancer, 2019. CA Cancer J Clin 2019 ; 69 : 7-34.

30. Haas NB, Appleman LJ, Stein M, et al. Inhibition de l'autophagie pour augmenter l'inhibition de mTOR : un essai de phase I/II sur l'évérolimus et l'hydroxychloroquine chez des patients atteints d'un carcinome à cellules rénales précédemment traité. Clin Cancer Res 2019 ; 25 :2080-7.

31. Xu J, Pham CG, Albanese SK, et al. Des clusters d'activation mTOR associés au cancer distincts du point de vue mécanique prédisent la sensibilité à la rapamycine. J Clin Invest 2016 ;126 :3526-40.

32. Linehan WM, Schmidt LS, Crooks DR, et al. La base métabolique du cancer du rein. Cancer Discover 2019 ; 9 :1006-21.

33. Hudes G, Carducci M, Tomczak P, et al. Temsirolimus, interféron alpha ou les deux pour le carcinome à cellules rénales avancé. N Engl J Med 2007;356 :2271-81.

34. Serra AL, Affiche D, Kistler AD, et al. Sirolimus et croissance rénale dans la polykystose rénale autosomique dominante. N Engl J Med 2010;363 :820-9.

35. Shillingford JM, Murcia NS, Larson CH, et al. La voie mTOR est régulée par la polycystine -1 et son inhibition inverse la cystogenèse rénale dans la maladie polykystique des reins. Proc Natl Acad Sci USA 2006;103 :5466-71.

36. Guo Z, Hong SY, Wang J, et al. Macrocycles inspirés de la rapamycine avec une nouvelle spécificité de cible. Nat Chem 2019 ; 11 :254-63.

37. Budde K, Becker T, Arns W, et al. Régime à base d'évérolimus et sans inhibiteur de la calcineurine chez les receveurs de greffes de rein de novo : un essai ouvert, randomisé et contrôlé. Lancet 2011 ; 377 :837-47.

38. Henske EP, Jozwiak S, Kingswood JC, et al. Complexe de sclérose tubéreuse. Nat Rev Dis Primers 2016;2:16035.

39. Narita M, Young AR, Arakawa S, et al. Le couplage spatial de mTOR et de l'autophagie augmente les phénotypes sécrétoires. Sciences 2011 ; 332 :966-70.

40. Natoli TA, Smith LA, Rogers KA, et al. L'inhibition de l'accumulation de glucosylcéramide entraîne un blocage efficace de la maladie polykystique des reins dans des modèles murins. Nat Med 2010 ; 16 :788-92.

41. Miller JL. Sirolimus approuvé avec indication de transplantation rénale. Am J Health Syst Pharm 1999;56 :2177-8.

42. StatBite : Approbations de produits pharmaceutiques oncologiques par la FDA en 2009. J Natl Cancer Inst 2010 ;102 : 219.

43. Chiew GGY, Wei N, Sultania S, et al. Co-culture tridimensionnelle bio-ingénierie de cellules cancéreuses et de cellules endothéliales : un système modèle pour la double analyse de la croissance tumorale et de l'angiogenèse. Biotechnol Bioeng 2017 ; 114 :1865-77.

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