Revue narrative sur un siècle de pandémies respiratoires, du Fu espagnol au COVID-19 et impact de la nanotechnologie sur le diagnostic COVID-19 et la stimulation du système immunitaire

Introduction

La propagation rapide dans l'ensemble de l'existant hautementcontagieux Syndrome Respiratoire Aigu Sévère-2(SRAS-2) ou soi-disant Coronavirus 2019 (COVID-19)maladie, nous a rappelé d'autres pandémies qui se sont produitesau siècle dernier (H1N1 fu espagnol) et a continuéau cours du siècle actuel par (SRAS, MERS et COVID-19) [1–3]. Après une série de pandémie virale respiratoiremaladies qui ont commencé en 1918-1919 par un mystérieuxet une maladie mortelle appelée grippe espagnole H1N1 et certainsles chercheurs l'ont appelé Mère des pandémies [4], en raison decette pandémie a infecté plus d'un tiers desla population mondiale et revendique environ 50 millionsvit, avec des symptômes cliniques inhabituellement extrêmeschez les jeunes adultes auparavant indemnes, la pandémiea été une cause majeure de décès [5]. À cet égard,Le SARS-CoV-2 et les virus de la grippe A/H1N1 1918 ontcertaines propriétés communes, comme être de mêmenombres de reproduction de base (R0), variant de 2 à 4,et des schémas d'excrétion similaires chez les patients infectieux,et donc susceptibles d'avoir des écarts de génération similaires. En tandem, COVID-19 peut avoir une période de latence similaire àcelle de la grippe [6]. Puis, dans le millénaire actuel,le monde a été témoin d'attaques virales persistantesune nouvelle famille virale appelée coronavirus (CoV) [7]. CoVs, contenant une sous-famille d'Orthocoronavirus etune sous-famille des Torovirinae. Te Orthocoronavirinae sousfamille comprend quatre genres : le coronavirus alpha,le bêta-coronavirus, le gamma-coronavirus et ledelta-coronavirus [8]. Encom genre de bêta coronaviruspasser du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS),Syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS), humainCoV-229E (HCoV-229E), HCoV-OC43 et CoronaVirus-2019 (COVID-19) [3].

En 2002, 2012 et 2019, le monde a été attaqué par troismaladies respiratoires virales SRAS, MERS etCOVID-19, en conséquence. Les coronavirus sont enveloppés,ARN non segmenté, sens positif, monobrinvirus qui montrent une apparence caractéristique sous negmicroscopie électronique à coloration active [9].

Extrait standardisé de Cistanche pour améliorer les systèmes immunitaires

L'OMS a rapporté que dans le sud de la Chineprovince de Guangdong, novembre 2002, pas de mise à joura été reçue du gouvernement chinois jusqu'aufin mars, 792 cas massifs et 31 décèsont été rapportés. Le ministère chinois de la Santé a annoncéplus de 8,000 cas. On estime qu'il y avait1 000 cas de maladie et environ 774 décès, ce qui donneun taux de létalité d'environ 7 pour cent. Le réservoir hôte duon pense que l'infection est la civette asiatique (Pagumalarves). On s'attendait à ce que le trans hôte-humainles sites de mission seraient des marchés ouverts, comme c'est le casl'épidémie actuelle de COVID-19. [10]. Le SRAS mondiall'épidémie a été maîtrisée avec succès en juillet 2003, et aucundes cas de SRAS ont été signalés depuis 2004. [11]. Lel'émergence du SRAS a été suivie par le MERS comme deuxièmecoronavirus le plus important causant un public mondialurgence sanitaire. Apparu pour la première fois en Arabie Saoudite (KSA)en 2012 lorsqu'un patient de 60 ans atteint d'une pneumonie sévère[10]. Une épidémie de virus n'est apparue qu'en2014, avec un nombre total de cas identifiés de 662 et un casindice de létalité de 32,97 pour cent. De 2014 à 2016, 1364 casont été observés en Arabie Saoudite [10]. Au total, 27 pays ontété touchés par le MERS lors des épidémies, en Asie,Europe, Moyen-Orient et Amérique du Nord. [12]. Lecas identifiés au-delà du Moyen-Orient, y compris leÉpidémie de Corée du Sud (SK) au cours de laquelle 186 personnes ontont été trouvés infectés à la suite d'une super propagationing, ont impliqué des receveurs de greffe qui ont déjàété infecté au Moyen-Orient. Depuis 2012, un total de2494 cas de MERS confirmés en laboratoire ont été signalés,avec 858 décès associés (taux de létalité de 34,4 %)[10].

En ce qui concerne le COVID-19, l'OMS a relevé le risqueniveau de la crise du CoV à "très élevé" le 28 février 2020.Le 11 mars, alors que des incidents COVID-19 en dehors de la Chinemultiplié par 13 et le nombre de personnes infectéespays a triplé pour atteindre plus de 118,000 enregistréscas dans 114 pays différents, avec plus de4,000 décès, l'OMS a déclaré COVID-19 un problème mondialpandémie. Les gouvernements du monde entier travaillentmettre en place des contre-mesures pour retenir leseffets délétères. Les organismes de santé coordonnentla circulation de l'information et l'émission de directives pour mieuxminimiser l'impact de la menace pandémique. Entre-temps,des chercheurs du monde entier travaillent intensémentet des informations sur les mécanismes de transmission,le spectre clinique du nouveau diagnostic de la maladie, de prévention et de traitement se développerapidement. De nombreuses inconnues concernant l'hôte du virusdynamique et les progrès de l'épidémie restent,y compris le moment de son apogée [13].

Les nanomatériaux (NM) ont des caractéristiques spécifiques qui sontuniques, qui les caractérisent comme des matériaux d'exceptioncapable d'appliquer dans les dispositifs, les capteurs et les techniques de spectreutilisé dans la détection de virus, le traitement et le virusélimination de l'environnement [14]. Une majeure partie deles applications des NM sont de prédire et de traiter les virus dansles soins de santé et l'environnement. Dans cette revue, nous sommesprésentation d'un bref sur certaines de ces utilisations.

Origine des maladies virales respiratoires pandémiques

La grippe aviaire se distingue par sa capacité àcontaminer diverses diversités animales, y compris des espècescomme les chauves-souris, les oiseaux et les mammifères. Même si réussila transmission interspécifique est rare, elle joue un rôle centraldans la génération de nouveaux vecteurs de la pandémie [14]. Dansla pandémie de 1918-1919, mars 1918 a été le débutde la vague printanière. Il s'est propagé à travers l'Europe, les États-Unis etAsie au cours des six prochains mois. Bien que les niveaux de maladieétaient élevés, les taux de mortalité dans la plupart des endroits n'étaient pasnettement plus élevé que d'habitude. Une deuxième vague ou vague d'automnerépartis dans le monde entier de septembre à novembre1918 et a été très meurtrière. Dans de nombreux pays, une troisième vagues'est produit au début de 1919. Les observateurs contemporains ont concludes similitudes cliniques qu'ils voyaientla même maladie infectieuse par vagues successives [4]. Teles formes bénignes d'épidémies dans les trois vagues étaient typiquesde la grippe observée lors de la pandémie de 1889 et de laépidémie de fu aviaire et années interpandémiques précédentes. Dansvue de cela, même la progression rapide d'uncompliinfection grippale à la pneumonie mortelle, caractéristiquedes vagues d'automne et d'hiver de 1918-1919, a étéobservé dans les quelques cas graves de la vague printanière [4, 15].

Jusqu'en 2003, seuls 2 CoV, le CoV humain 229E (HCoV-229E) et HCoV-OC43 sont connus pour entraînermaladie humaine [16]. Elle se manifeste par des symptômes bénins telscomme un rhume chez les adultes et une maladie plus grave chezles nourrissons, les personnes âgées et les personnes immunodéprimées. Dansnovembre 2002, de nombreux cas exceptionnels de «pneumonie" des raisons inexpliquées ont été rapportées dans leville de Foshan, province du Guangdong, en Chine, oùde nombreux personnels de santé ont été contaminés [17]. C'étaitintroduit à Hong Kong le 21 février 2003 par un médecinqui ont traité des cas similaires de SRAS en Chinecontinentale, ce qui a entraîné une généralisation de la pneumonie graveà Hong Kong et qualifiée par l'OMS de "sévèresyndrome respiratoire aigu" le 15 mars 2003 [18, 19]. Les mois ont passé et un certain nombre d'incidents du SRAS ontété identifié avant que le SRAS-CoV ne soit identifié. Un nouveaub-CoV (SARS-CoV) de la lignée B a été confirmé comme lecause des cas de pneumonie du SRAS le 22 mars 2003.La pandémie de SRAS-CoV s'est propagée à 29 payset les régions. Il était clair que la santé mondiale, mediles communautés de développement cal et scientifique n'étaient passuffisamment préparés à l'émergence du SRAS. [18]. Des chaînes de transmission interhumaines ont émergéau Canada, à Toronto, au Taipei chinois, à Hong Kong, en Chine,Vietnam Singapour et Hanoï. L'épidémie de SRAS avaitune brève histoire et l'OMS a annoncé la liquidationchute de l'épidémie de SRAS en juillet 2003 [18].

Dix ans après le dernier signe du SRAS-CoV, en juin2012, un homme est décédé en Arabie saoudite d'une pneumonie grave et d'une atteinte rénalefaiblesse [20]. Un coronavirus nouvellement découvert,le Moyen-Orient-Syndrome-Respiratoire-Coronavirus(MERS-CoV), a été identifié à partir de ses crachats [21]. Un groupe de cas de maladies respiratoires graves est apparuen avril 2012 en Jordanie dans un hôpital et ont été diagnostiquésrétrospectivement comme MERS12 et un groupe de trois personnes infectées par le MERSdes cas au Royaume-Uni ont été détectés en septembre2012 Le MERS-CoV a continué d'augmenter et de s'étendre à l'extérieurla "péninsule arabique". À la suite d'un voyage enpersonnes contaminées; fréquemment ces nouveaux transcas de MERS transmis ont entraîné des maladies nosocomialesTransmission.[22]. En mai 2015, l'épidémie de MERS enSK a été déclenché par un seul rapatrié du MoyenEst et touché seize cliniques et 186 cas. A partir du 26avril 2016, 1 728 cas de MERS ont été confirmés, dontdont 624 morts dans 27 pays différents [22]. 

Un groupe de cas de pneumonie liés à une découverte récente-le coronavirus est apparu à Wuhan, en Chine, endécembre 2019. Le 12 janvier 2020, le Conseil mondial de la santéinternationale (OMS) a désigné ce coronavirus comme le roman 2019coronavirus (2019-nCoV) (OMS). InterneComité national a proposé de nommer les nouveauxcoronavirus comme SRAS-CoV-2, tous deux signalés le 11 févrierjanvier 2020. Des scientifiques chinois ont rapidement isolé le SRASCoV-2 d'un patient le 7 janvier 2020. Ils sont sortisau séquençage du génome du SARS-CoV-2. A partir du 1er juillet2021, 91 833 cas de COVID-19 ont été confirmés enChine continentale dont 4636 décès. La reproduction de basele nombre "R0" de SARS-CoV-2 a été évaluéselon les études à environ 2,2 ou plus (fourchette de 1,4 à 6,5), etles regroupements d'épidémies de pneumonie familiale ajoutent à la preuve deune épidémie de COVID -19 en constante augmentation par le biais d'interactions interhumainestransmission (fig.1) [23]. D'après l'OMS (https://covid19.who.int/ (en anglais seulement)); à l'échelle mondiale, à 20h36 CEST, le 14 avril 2022, il y avaitété 500 186 525 cas confirmés de COVID-19, y compris6 190 349 décès, signalés à l'OMS. Au 18 avril2022, un total de 11 307 908 653 doses de vaccin ont étéadministré.

Réservoir et mode de transmission

Les virus grippaux de différentes espèces sont connus pour provenirchez la sauvagine sauvage. (Figue.2) [24]. Tandis que l'homme-cochonles sous-types de transmission ont déjà été montrés ettransmission directe avérée entre oiseaux etl'homme a été moins répandu (comme dans le cas du H9N2et sous-types H5N1) mais a dans certains cas entraînédécès. [25].

Le réservoir de la famille des coronaviridae quise compose de bêta-coronavirus comprend trois pandemics récemment (SARS, MERS, COVID-19). Les chauves-souris sont un énormeréservoir naturel large éventail de CoV, y compris de type SRAS-CoVet les virus de type MERS-CoV (Fig.2). Suivantla séquence génomique du virus, COVID-19 a été étudiée,le génome de Bat CoV RaTG13 a montré 96,2 pour centidentité globale de la série génomique, indiquant le CoVchauve-souris Même le SRAS-CoV humain-2 peut avoir le même parentâge. En revanche, les chauves-souris ne sont pas disponibles à l'achat dans cemarché des fruits de mer. Au fait, la synchronisationdes séquences protéiques et la poursuite de l'étude phylogénétiquea révélé des résidus similaires récepteur a été trouvé dans plusieursespèces, qui offraient plus de possibilités d'alternativehôtes intermédiaires ; Pour les entrées, tortues, pangolin etcollations [23].

Tous les virus respiratoires pandémiques sont des zoonoses aéroportésLes virus à ARN qui se transmettent rarement entreformes natives d'humains mais pourraient muter pour devenir humainstransmission plus efficace. Fréquent et approuvétransmission routes droppings (>5 mm de diamètre, volantTransmission'<1  m) make contact with the nose with virus viables, de la bouche, des yeux ou des voies respiratoires supérieures et en suspension dans l'airtransmission' où des gouttelettes (5 mm de diamètre) sontnoyaux [27]. 2002 et 2003 étaient des exemples du H1N1pandémie de grippe dans le SRAS et 2009.

La fonction de 'communication directe du toucher' (sansla possibilité de surfaces polluées) et 'indirectpropagation par contact» (y compris les surfaces infectées) dula distribution de ces virus à potentiel pandémique ontété controversée. Néanmoins, divers rapports etdes enquêtes ont rapporté que la communication indirectela transmission est répandue. Le chemin de transmission pourd'autres virus respiratoires, ainsi que la grippe, sous certainesconditions [26].

Réplication du virus SARS‑CoV‑2

La réplication du virus de la grippe se produit au niveau cellulaireprincipalement dans les cellules épithéliales du tractus intestinaloiseaux et dans les cellules épithéliales des voies respiratoires chezhumains et autres mammifères [27]. Chez l'homme, les ribonucléoprotéines(vRNP) sont ensuite transmises dansle noyau des cellules malades, dans lequel transcrit l'ARN viralet se réplique grâce à l'activité enzymatique dele complexe polymérase viral attaché aux vRNPs [28]. Tela réplication de l'ARN viral se produit via un intermédiaire positifate, le complexe ribonucléoprotéique complémentaire [29]. La transcription de l'ARN viral produit un brin positifARNm lié au capuchon et polyadénylé puisexporté vers le cytoplasme pour être traduit en protéines virales. [30]. Polymérases virales nouvellement synthétisées (PA,PB1 et PB2) et les NP virales sont importées dans le noyaupour augmenter le taux de synthèse de l'ARN viral, tandis que le virusles protéines membranaires HA, NA et M2 sont transportées etincorporé dans la membrane plasmique [31].

Le MERS-CoV et le SARS-CoV ont un codage spécifiquemécanisme dans lequel environ les deux tiers des "virauxARN" est traduit en deux polyprotéines géantes, tandis quele génome viral restant est transcrit dans unsérie d'ARNm sous-génomiques [22]. Dans pp1a etpp1ab, les polyprotéines codent pour seize protéines non structurelles. (nsp1–nsp16) qui fait apparaître la réplicase viralecomplexe transcriptase [32]. Les polyprotéines sont clivéespar la protéase de type papaïne (PLpro; correspondant à nsp3)deux protéases, et la protéase Te, protéase de type 3C(3CLpro ; correspondant à nsp5). nsps réorganiser membranes dérivées du réticulum endoplasmique rugueux(RER) en vésicules à double membrane, dans lesquellesla transcription et la réplication du virus ont lieu. Te exola fonction ribonucléase (ExoN) de nsp14 est une caractéristique uniquedes coronavirus, qui fournit la correctioncapacité nécessaire pour maintenir un génome d'ARN à grande échellesans accumuler de mutations nocives. MERS-CoVet le SRAS-CoV transcrivent 9 et 12 ARN sous-génomiquesrespectivement. Ceux-ci codent les quatre protéines structurales,à savoir la protéine de pointe (S), l'enveloppe (E), la nucléocapside(N), membrane (M) et plusieurs protéines accessoires quine participent pas à la réplication virale mais interfèrent avecla réponse immunitaire innée de l'hôte ou dont la fonction estinconnu ou mal compris.

L'enveloppe "E" glycoprotéine de pointe "S" s'accroche à son cellulairerécepteur, enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2)pour le SRAS-CoV et la dipeptidyl peptidase 4 (DPP4) pourMERS-CoV. Le "génome de l'ARN viral" est livré dansle cytoplasme après fusion membranaire, les émissions vers lemembrane de la cellule hôte ou à la membrane de l'endosome.Te ARN est déballé pour permettre la traduction des deuxpolyprotéines, transcription des ARN sous-génomiques, etréplication du génome viral. L'enveloppe résultanteles glycoprotéines sont introduites dans les membranes du RER ou de Golgi; l'ARN génomique et les protéines de la nucléocapside viennentensemble pour former les nucléocapsides. Bourgeon de particules viralesdans le compartiment intermédiaire ER-Golgi (ERGIC). Leles vésicules contenant le virus fusionnent ensuite avec la membrane plasmiquedélivrer le virus [22]. 

Concernant le COVID-19 (Fig.3), l'ARN génomique est utilisécomme échafaudage pour traduire directement la polyprotéine 1a/1ab(pp1a/pp1ab), qui code pour des protéines non structurelles(nsps) pour rendre le complexe réplication-transcription(RTC) dans les vésicules à double membrane (DMV). Finalement,un ensemble imbriqué d'ARN sous-génomiques (ARNsg) est synthétisépar le RTC dans un mode discontinu de transcription. Ces ARN messagers subgénomiques (ARNsg)avoir en commun 5′-chef et 3′-séquences terminales. etAcquisition ultérieure et résiliation de la transcriptiond'un ARN leader se produit au niveau de la régulation transcriptionnelleséquences situées entre les cadres de lecture ouverts (ORF).Ces ARNg à brin négatif agissent comme une matrice pour le subgenomicproduction d'ARNm.

Un génome et des sous-génomes typiques du CoV comprennent auminimum six ORF. Les premiers "ORFs (ORF1a/b), quireprésentent environ les deux tiers de la longueur totale du génome,code pour 16 siestes (nsp1-16), à l'exception de Gamvirus macorona, qui n'a pas de nsp1. Il y a un−1 cadredécalage entre ORF1a et ORF1b, entraînant la productionde deux polypeptides : pp1a et pp1ab. Ces polypeptides sont traités en 16 siestes par le virus codéprotéase de type chymotrypsine (3CLpro) ou protéase maître(Mpro) et une ou deux protéases de type papaïne. AutreORF sur un tiers du génome près du 3′-astuce encoderau moins quatre protéines structurelles majeures : (S), (M), (E) et(N) [33]. Divers CoV encodent des structures etdes protéines accessoires, comme la protéine HE, la protéine 3a/b,et la protéine 4a/b, en plus de ces quatre basesprotéines de structure. Les sgRNA CoV sont utilisés pour traduire tousprotéines structurales et accessoires [34].

Adaptation virale nécessaire pour le changement d'hôteet déterminants de la pathogénicité

Le virus de la grippe A transformera les hôtes et créera une nouvellelignée [35]. Cette infection, dite zoonotiqueoffre une chance d'adapter le virus au prochain hôte, etles pandémies qui en résultent. Lorsque le virus de la grippe A pénètrele corps, la molécule grippée HA (hémagglutinine)accepte l'acide sialique (N-acétylneuraminique) autour du sommetde la cellule hôte [36]. HA est un type transmembranaire de glycoprotéine sous forme d'homotrimère introduit dans la feuille virale.Chaque monomère est composé de deux sous-unités, HA2 etHA1. Dans la région de faible pH de l'endosome, HA clivé avec unla fusion du domaine de la tige HA2 fusogène médie l'endosomalmembrane avec la membrane virale, ce qui rendentrée virale de la ribonucléoprotéine forte (vRNP) dans la cellule hôte[37]. 

Le "complexe vRNP comprend 8 simples brins,ARNv de nucléoprotéine de sens négatif (NP) et ARN pourinfluenza-A polymérase "(composé PA, PB1 et PB2)[28]. Avec la fusion ultérieure, le complexe vRNP peutêtre libéré dans le cytoplasme de la cellule, après quoi il entrele noyau par transport réussi [37]. Le noyauest l'endroit où la synthèse de l'ARN de tous les virus de la grippe prendlieu. Commencer le processus de transcription ; ARN polymérasele virus se lie à hautement retenu et presque complémentaire13 à la fin de la 5' nucléaire et 12 à la fin deles huit segments du nucléotide 3'. Néanmoins, la polymérasele virus de la grippe n'a pas d'activité de coiffage inhérente. Ilrésume l'utilisation des ARN 5' hôte cap pré-ARNm mas viralsager Un mécanisme spécial de médiation "cap snatching"PB1 et PB2 dérivés de protéines de transcriptions cellulaires[28]. La protéine NS1 non structurelle affecte le morphogène viralesis plus tard dans les particules du cycle de réplication virale. Cependant,ce ne sont pas des particules structurelles virales [38].

L'identification des récepteurs représente l'étape initiale deinfection virale des cellules hôtes et est l'un des plus essentielsfacteurs d'infection virale et de pathogenèse [39]. Bien que de nombreux autres facteurs liés aux hôtes et aux virus puissentinfluencent également l'efficacité de l'infection et de la réplicationdu virus chez un hôte spécifique, ces facteurs neentrent en jeu une fois que le virus est lié à une membrane cellulairedestinataire [40]. Les coronavirus (CoV) ont ungénome à ARN monocaténaire enveloppé qui codequatre protéines membranaires, à savoir la pointe, la membrane,les protéines d'enveloppe et de nucléocapside comme le montre la Fig.3 [2, 41]. Les protéines S sont importantes pour une entrée virale conpathogénicité [42]. Sur l'enveloppe du SARS-CoVlope "E", un trimère S médiatise la pénétration de lavirus dans les cellules hôtes. Il se connecte d'abord à son récepteur hôte,l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2), etfusionne ensuite les membranes de l'hôte et du virus [43]. Un domaine de liaison au récepteur (RBD) donné sur le "S"Le SRAS-CoV est suffisant pour se lier avec une haute affinité àAC2 [44]. Un élément important dans la pathogenèsedu SARS-CoV et des infections inter-espèces a étéidentifié comme l'affinité de liaison RBD/ACE2 [45]. Leréactivité croisée expérimentale des anticorps anti-SARS-CoVavec des 2019-protéines de pointe nCoV, qui pourraient avoirdes conséquences importantes pour la fabrication rapided'anticorps et de vaccins pour combattre le 2019-nCoV,est donc nécessaire de toute urgence [46].

Facteurs de virulence des virus pandémiques

Les facteurs de virulence sont considérés comme l'un des éléments vitauxqui joue un rôle important dans l'adaptation du virus dans lecellule hôte [47]. Concernant la grippe pandémique, Hémagglutinine(HA) fait partie de la glycoprotéine de surface duvirus. avec deux rôles principaux dans la toute première phase deréplication virale : fusion membranaire et liaison des récepteurs[48]. Les HA du pathogène élevé du virus de la grippe aviairecontribution importante à la virulence. Ils ont généralementune séquence spécifique (c'est-à-dire une séquence d'acides aminés basiquesau site de clivage qui contribue à la prévalence de la pathogénicité). [49]. Ce modèle, bien qu'il ne soit pas reflétédans la séquence HA de 1918. Néanmoins, il avait étémontré qu'un virus réaffirmant avec l'histoire génétique1918 HA répété à un titre significativement élevé dans lepoumons, et avec un afflux important de poumons provenant des neutrophileset les macrophages des alvéoles ont causé de graves lésions pulmonaires. Le vrai virus de 1918 avec une morbidité importante etla mort ultérieure a montré des résultats similaires. Ces résultatsindiquent un rôle important dans la maladie du virus de 1918pour le gène HA [50]. La ou les zones de haute virulence de HAn'a pas encore été découvert. L'autre facteur central del'épidémie de 1918 est la virulence. Une caractéristique inhabituellede la pandémie de 1918 était que de nombreuses personnes avaientdécédé d'une pneumonie virale; les virus de la grippe virale danssystème pulmonaire des personnes infectées se répliquent généralementmal et souvent entraîner une pneumonie virale potentiellement mortelle [51]. Dans le système pulmonaire des filaments infectéset primates non humains, nous enregistrons uneréplication du virus de 1918, qui a contribué à lapneumonie.

En comparaison, les poumons des animaux infectés n'ont pasavoir un virus H1N1 humain contemporain, même s'ilreproduit dans les fosses nasales. Par conséquent, nous concluonsque la capacité du virus de 1918 à se propager dans les poumons estlié à sa haute virulence humaine [51]. On note égalementque les titres viraux élevés étaient basés sur les gènes NP etpolymérase dans les poumons de furets infectés en 1918 [52]. Les gènes de la polymérase sont également importants dans la pathogénicitéet transmission de la souris chez le furet [53]. Cesles résultats impliquent fortement le complexe ARN polymérase virale dansla transmission réussie du virus aux voies respiratoires bassestract et indiquer que, en combinaison avec unHA, il peut être suffisant pour induire une pneumonie mortellependant la pandémie de 1918-1919 [54]. Pathogénicitépeut également être corrélé avec d'autres facteurs viraux comme lecas de pandémie NA, NS1, PB1-F2, et autres en 1918.La protéine virale pro-apoptotique PB1-F2 n'a besoin que dudéplacement d'un acide aminé à la 66e position pour améliorerla virulence du virus en 1918 [51]. Le PB de 19181-F2l'expression favorise la pathologie pulmonaire dans le primaireinfections virales et bactériennes secondaires [51].

Respecter les bêta-coronavirus (SARS, MERS, etCOVID-19), ils contiennent de la protéine E composée de plusieursmotifs actifs entre 76 et 109 amino dépendants du CoVacides compte tenu de sa taille limitée [55]. Modification ou suppressionde la protéine E dans différents CoV a donné lieu à des virusavec des phénotypes différents et des interrelations inhabituellesentre le virus et l'hôte, y compris l'induction de stresset des réactions protéiques ou des changements de concentrations avecion cellulaire en raison de l'activité du canal ionique de la protéine E [55, 56]. Toutes ces pratiques ont un effet important sur lapathogenèse du CoV. De plus, dans COVID-19 "S" estla principale définition du tropisme cellulaire et donc interspecies la transmission des CoV, car il lie le virus à un réseau cellulairerécepteur et catalyse ensuite l'entrée de la fusion membranairedu virus [57]. La structure 3D en microscopie électroniquedu 2019-nCoV viral S a montré sa similarité avec leS des autres COV [57]. Les autres caractéristiques ded'autres CoV peuvent ainsi être déduits. Viral S est un transmembranaireprotéine transmembranaire de type I avec une extrémité n-terminalepeptide signal clivable, un grand peptide hautement n-glycosylée, une queue transmembranaire et cytoplasmique intégrée dansun groupe de résidus collaté S [57]. L'ectodomaine aété divisé dans le domaine S1 très variable entreles genres et le domaine S2 qui est plus conservé etcatalyse la fusion membranaire. L'opéra qui lie les destinatairestion provoque la pathogénicité [58].

Symptômes et manifestations cliniques

Le virus de la grippe pandémique H1N1 en 1918-1919 avecness variations des signes et des symptômes selon de nombreuxfacteurs tels que la gravité des cas, l'âge de la personne,et saison [59]. La maladie bénigne et peu claire comme prédominantdans les vagues de héraut du printemps incluaient des symptômes de lavoies respiratoires supérieures, comme le mal de gorge, la rhinopharyngite, et toux, ainsi que des manifestations systémiquesde fièvre, de myalgie et de prostration (Fig.4) [60]. Épistaxisa été réalisée dans les cas légers et graves [61]. Le médecin rapporte trois mille cas au campFremont a noté que l'épistaxis était une caractéristique communede toute la pandémie [60]. Cela a été considéréune caractéristique de la maladie car le sang coulait toujoursdu nez et de la bouche du patient. La duréede maladie modérée était généralement limitée à 72 h. Typiquement, la toux n'était pas productive. La fièvre était répanduejusqu'à 104 degrés F. Prostration parfois soudaine et extrême[62]. Une définition du patient comme « rapidement ou presquesaisi de façon inattendue d'un sentiment de prostration qui futcomplètement incapable de faire ce qu'il pouvait. Il y avaitdétresse respiratoire importante chez les patients atteints d'une maladie grave [62]. Leurs symptômes comprenaient descyanose, faim dans l'air, conscience réduite et diffusionrâles bouillonnants d'œdème pulmonaire très progressif(Figue.4). Te cyanose de la cyanose héliotrope trouvée danscertains patients avant la mort après la fleur d'héliotropecouleur bleu foncé ou violet. Les médecins notent également d'abord queles lèvres et les oreilles sont d'un bleu intense avant de se concentrer surle reste du visage [31]. Dans une lettre au médecin d'un collègue, certains ont décrit la couleur comme noir violacé et unUn médecin écossais qui travaille au camp Deven a noté que"les hommes de couleur blanche ne sont pas faciles à distinguer." Dansle pigment anormal, un médecin a déterminé que la cyanoseest due à des exsudats importants dans les alvéoles empêchantbonne oxygénation lorsqu'un contrôle spectrographique répétédu sang du patient n'a pas été trouvé [60]. Deux psychiatresaffections liées à des troubles respiratoires aigus.Le syndrome de mortalité rapide (SDRA) et des cas mortels ont étéidentifié de bronchopneumonie. Une bactérie secondairel'infection conduisant à la bronchopneumonie a causé lala plupart des décès dus à la pneumonie, à l'exception des personnes tuéesen 1918 après l'épidémie de H1N1 [60]. Leucémie initialela pénie a été suivie d'une bronchopneumonie leucocytose [63]. Brundage et Shanks [64], a enregistré une médianepériode de 7 à 10 nuits à partir du début de la maladie et plusieurs deaths>15 jours après le début, en association avecpneumonie bactérienne secondaire, pour les plus touchéspopulation.

En cas de SRAS, fièvre, frissons, frissons, myalgies, sécheresseles toxines, la dyspnée, les malaises et les maux de tête sont les principaux signes distinctifscaractéristiques cliniques du SRAS [65]. Plus populairemaux de gorge, diarrhée, rhinorrhée, nausées, vomissements,et gonflement [65]. Chez 40 à 70 % des patients atteints du SRAS, desla diarrhée était présente. Cela avait tendance à se produire environ 7 joursaprès le début de la maladie [18]. Deux patients compliépileptiques ont été détectés dans le sérum etliquide cérébro-spinal. Patients âgés infectés par le SRAS-CoVpeut développer un faible appétit, diminution du bien-être général, fracture de chute et incertitude, mais peut ne pas être en mesureprovoquer des réactions fébriles chez certaines personnes âgées [66]. En comparaison, l'infection par le SRAS-CoV était généralement bénignechez les enfants de moins de 12 ans. En revanche, l'infection chez l'adulteenfants était proche de celle des adultes [67]. SRAS-CoV-acL'infection par Quired était liée à un taux de létalité de 25 %.pendant la grossesse, une incidence élevée d'avortement spontané, accouchement prématuré et retard de développement duenfant intra-utérin sans infection périnatale par le SRAS-CoV[18].

Les adultes infectés par le MERS-CoV peuventdévelopper une gamme de maladies et de gravité de la maladie, deasymptomatique à léger, modéré ou sévère (Fig.4) [68]. Le temps d'incubation est de 2 à 14 jours. De qualité inférieurefièvre, écoulement nasal, mal de gorge, toux sèche et myalgiepeuvent survenir chez les patients atteints d'infections bénignes. Les patients avecinfections graves avez une pneumonie aiguë Syndrome dedouleurs respiratoires, une défaillance organique du régime multilatéral, etmaladie. De plus, d'autres membres mesurent le pneumoprogression de la nia en notant le nombre de radiographies pulmonaireszones chez les patients présentant une infection sévère, montrant desprogression après environ sept jours et sévéritépneumonie. Les symptômes ont culminé après environQuatorze jours. Le MERS-CoV est plus important dans les voies respiratoires inférieureséchantillons des voies que dans les voies respiratoires supérieureséchantillons. De plus, les caractéristiques extrapulmonaires sont courantes, dont la myalgie. Retour à la moitié de tous les MERS-CoVpatients, un tiers des personnes gravement malades, y compris abdominauxdouleurs, nausées, vomissements et diarrhée, éprouventlésion rénale aiguë. Un tiers sont gastro-intestinaux, etLe MERS-CoV dans les selles peut être trouvé [68].

Concernant le COVID-19 la fatigue et la toux sont des myalgiesou fatigue [69], les symptômes les plus fréquemment rapportés.L'expectoration, les maux de tête, l'hémoptysie et la diarrhée ont étésymptômes moins fréquents [70, 71], et dans plus de la moitié despatients, une dyspnée s'est développée (Fig.4). Les résultats de lades tests sanguins ont montré que le globule blanc et la lymphopénieétaient normaux ou réduits [72]. Te typique ICU admisLes images de tomodensitométrie thoracique étaient bilatérales, multilobulaires etzones de consolidation des sous-segments [73]. Patients non hospitalisésopacité bilatérale démontrée du verre dépoli et sous-segmentairezones de consolidation par scanner thoracique représentatifConclusions [74]. Des études en laboratoire ont montré que le plusles symptômes fréquents sont la toux (67,7 %) et la fièvre (87,9 %)tandis que la diarrhée est rare. 82,1 % des personnes admises en soins intensifsles patients ont signalé une lymphopénie [75].

Épidémiologie

Le degré exact de morbidité et de décès liés à la pandémie1918 n'est pas connu parce que la grippe ne diffère pas deautres maladies respiratoires sans confirmation en laboratoire [76]. Les échantillons d'autopsie analysés sont principalement les poumonstissu des morts qui sont morts à l'automne de1918 [77]. Il manque également des détails épidémiologiques.Le te fu n'était pas une maladie à déclaration obligatoire ou une maladie surveilléeavant la pandémie dans tout public provincial ou fédéralorganisme de santé. Après la pandémie, la mort est devenueapparente à l'automne 1918, En outre, les communautésont commencé à avoir des forces physiques pour enregistrer les cas degrippe [78]. Néanmoins, de nombreux cas ont évité un signalement fiableet/ou des rapports en temps opportun. Dans le public américainHealth Journal de janvier 1919, écrit l'éditeur dansplusieurs cas où les données étaient incomplètes et trompeusesparce que "la demande d'intervention était si forte, quetrès peu étaient disposés à se concentrer sur la recherche à l'avenir[60]. Signalé depuis le milieu du XVIIIe siècle,des pandémies importantes se sont produites entre le 10 et40 ans. Parmi ceux-ci, la pandémie de "fu espagnol" en 1918était le pire au monde, tuant 20 à 40 millions de personnes ou pluspersonnes (ill.5) [79].

En 2002, une épidémie de SRAS originaire de Guangdong enLa Chine a déclenché la première maladie infectieuse majeuredu XXIe siècle, avec 916 décès parmi plus de8098 patients dans 29 pays. Dix ans plus tard, 2254 cas déclarés en laboratoirecas de MERS-CoV ont été déclarés par leL'OMS, avec 800 décès dans 27 pays, de 2012 à 16Septembre 2018 [80] (Figue.5). De manière significative, plus de quatre-vingts% des études récentes en virologie et génétique de ceont démontré que le MERS-CoV etLes chauves-souris du SRAS pourraient être des réservoirs naturels potentiels. de confirmécas de SRAS, 22 pour cent étaient des agents de santéChine et plus de 40 pour cent étaient des agents de santé enCanada [81]. De même, la transmission nosocomiale du MERSétait au Moyen-Orient et en Corée. Les cas signalésau Moyen-Orient et en Afrique du Nord ont tous contribuéaux épidémies dans d'autres pays et à leur transmissionen raison de voyages internationaux. SRAS et MERScontribué à des problèmes massifs de santé publique et économique

épidémies [80].

Facteurs de l'hôte liés à la morbidité pandémiqueet variations de la mortalité

Réponses immunitaires et immunopathologie

Les cellules dendritiques (CD) contribuent de manière significative à laimmunité et peut initier de grandes quantités de chimiokineset les cytokines [82]. Ces cellules peuvent migrer vers le lymphoïdetissu du tissu périphérique pour activer le populations des lymphocytes T [83]. De l'autre côté, la clé del'immunité contre les infections virales est les cellules T adaptatives[84] ; CD4plusLes lymphocytes T facilitent l'anticorps spécifique du virusproduction par activation T-dépendante des cellules B [85]. "CD8plusLes lymphocytes T" sont néanmoins cytotoxiques, tuant les virus[86]. 

Les réponses immunitaires innées au moment de la grippe peuventêtre défini comme interactif entre les sécrétions muqueuseset virions, les infections des cellules épithéliales et l'activationd'autres types de résidents de l'épithélium ou sous-épicouches théliales [87]. Qui impliquent des cellules lymphoïdes "innées",les macrophages résidents et les cellules dendritiques (dontmacrophages alvéolaires) [87]. Après le recrutement du sangaux sites d'infection, d'autres typologies cellulaires comme poly-morles leucocytes phononucléaires et les monocytes agissent [88]. Chaque type de cellule affiche un ensemble différent d'offres, ils peuventsensibiliser la présence du virus et permettre une protection spécialeles fonctions.

De plus, les récepteurs sont stratégiquement situés dansplusieurs composants subcellulaires comme les membranes cellulaires,endosomes, cytosol et mitochondries [89]. Ceci permetl'hôte pour monter des défenses adaptées à l'envahisseurpathogène et prendre son tropisme, mode de vie intracellulaire,et la stratégie de reproduction en compte [90]. Pour fuet d'autres infections, par conséquent, les réponses innées peuventêtre commodément divisé en modules, dont chacunimplique des types de cellules spécifiques, des récepteurs, des molécules deles défecteurs et les compartiments intracellulaires. Leles composants du module grippe contiennent (1) solvaprotéines extracellulaires ble contenant des fluides corporels; (2)le système interféron; (3) différents types de cytokineset des chimiokines capables d'orchestrer une réponse innée ;(4) phagocytose des macrophages et des neutrophiles; (5) dendritiqueprésentation de l'antigène cellulaire [91].

Dans le cas de l'infection par le SRAS, Comme leles réponses immunitaires acquises aident à contrôler les viruset maladies bénignes, dysrégulation des cytokines, cyto viralesymptômes pathologiques, régulation négative des poumons de l'ACE 2, irrégulierréponse immunitaire et processus auto-immunsentraîner une maladie plus grave et éventuellement la mort, lala progression du SRAS peut être liée à desimmunité contre T-helper (T1) et inflammatoireréponse hyper-innée [92]. 

Amélioration significative en "T1 et inflammatoirecytokines (interféron-g [IFN-g], interleukine-1 [IL-1],IL-6 et IL-12), ainsi qu'une augmentation significative dechimiokines comme la chimiokine T1, IFN-g, IL-10 inductible,(IP-10) chimiokine neutrophile et protéine monocyte-1des attractions de chimiokines ont été observées pendant deux semainesaprès le début de la maladie dans une étude de recherche menéechez 20 adultes infectés par le SRAS-CoV [18].

Les mécanismes de réponse immunitaire provoqués par le MERSLes stratégies d'infection par le CoV et d'évasion immunitaire ontpas encore été complètement exploré. D'un intérêt particulier,Le MERS-CoV a développé des stratégies de contrôle de l'immunité innéeet a empêché ou bloqué les voies de production d'IFN [93]. Cette compétence peut être en grande partie responsable deles taux de mortalité élevés des patients atteints de MERS-CoV, en particulierceux dont le système immunitaire est compromis. Une fois le virusa été reconnu comme récepteur de type Toll (TLR), l'undes deux molécules adaptatrices différentes est recruté soitMyD88 (réponse primaire de différence myéloïde 88) ouToll / Interleukine-1 domaine du récepteur (TIR-) contenantAdapter-Inducing Interferon- (TRIF). Les moléculesactivent également les voies MAPK et NF-ŚB qui favorisentle développement de retardateurs pro-inflammatoireset les IFN"[93].

Pendant l'infection COVID-19 à la fois innée et adaptativeles cellules immunitaires sont impliquées de manière synergique dans l'action antiviraleréponse. Te taux de lymphocytes et sous-ensembles de Tcellules qui jouent un rôle important dans la régulation du système immunitairela réponse diffère avec les mécanismes pathologiques viraux potentielsselon le type de virus. Une hausse considérabledans les neutrophiles, les leucocytes et les neutrophiles-lymphocytesratio (NLR) a été observé dans les cas graves de COVID-19par rapport aux cas bénins [96]. Lymphopénie proéminente,ce qui indique une altération du système immunitaire,survient chez la plupart des patients atteints de COVID-19, en particulier chezles plus sévères [97]. Il semble donc que les leucocyteset les neutrophiles peuvent renforcer la tempête de cytokines (CS)autres que les lymphocytes COVID-19.Les travaux antérieurs ont diminué le nombre global de lymphocyteset cellules T chez les patients infectés par le SRAS-CoV [94]. L'infection par le SRAS-CoV-2 peut entraînertroubles immunitaires dérégulation en affectant la cellule Tsous-ensembles [95–97]. Un soulagement significatif des lymphocytes T est observédans le COVID-19 et est plus prononcé dans les cas graves.Chez les patients COVID-19, les niveaux de cellules (CD3plus, CD8plus), lymphocytes T suppresseurs et auxiliaires cytotoxiques (CD4plus, CD3plus), et les cellules T régulatrices sont inférieures aux niveaux normaux. DansEn revanche, les lymphocytes T auxiliaires et les lymphocytes T régulateurs sont remarquablementplus faible chez les patients sévères que chez les patients non sévèrescomme le montre la Fig.6 [98]. Les cellules T régulatrices sont connues pour êtreresponsable du maintien de l'homéostasie immunitaire en supprimantl'activation, la prolifération et le pro-incantatoirefonction de la plupart des lymphocytes, y compris les cellules NK, TCD de cellulesplus4, CD des lymphocytes Tplus8, et les cellules B (Fig.6) [99]. Aussi,le pourcentage de lymphocytes T auxiliaires naïfs s'amplifie.

En revanche, le pourcentage de lymphocytes T auxiliaires de la mémoireet CD28plusles lymphocytes T suppresseurs cytotoxiques diminuentcellules COVID-19 sévères [100]. L'équilibre entre lales lymphocytes T naïfs et les lymphocytes T mémoire est fondamental pourla réponse immunitaire efficace. Outre les lymphocytes T, une réductiondes cellules NK et des cellules B est observée dans COVID-19 [101]. Dans l'ensemble, ces résultats indiquent que le SARS-CoV-2 indique le SRAS-CoV-2 est responsable de la maladie immunitairerégulation avec induction de cytokines aberrantes etréponses aux chimiokines [102], et l'altération de la lymphosous-groupe de cytes, qui pourraient tous conduire à des tempêtes de cytokineset d'autres lésions tissulaires [103]. Inflammatoire excessifréponse avec une caractéristique de la cause des tempêtes de cytokinesmaladie grave et aggrave le pronostic COVID-19[104].

Âge

L'âge d'un individu affecté joue un rôle majeur dans l'identificationleur risque de décès lors de la grippe de 1918pandémie. En général, lorsque les décès dus à la grippe saisonnièreles taux sont tracés en fonction de l'âge de la population,une courbe en forme de "U" est obtenue, avec le plus haut niveau demortalité observée chez les jeunes et les personnes âgées [6]. Inversement, les épidémies pandémiques (à des degrés divers) sontcaractérisée par une évolution de la létalité vers le plus jeune âgegroupes. Cela a été particulièrement marqué au cours de la 1918pandémie alors que les jeunes adultes (15 à 30 ans) avaient généralementun taux de mortalité élevé qu'une courbe de mortalité "W" a été générée [6]. Pour le SRAS, des personnes de tous âges ont été infectées, et lel'âge médian était inférieur à quarante-cinq ans. Soins de santéles travailleurs représentaient 22% de tous les cas à Hong Kong et22,8 % dans le Guangdong. Au Canada et à Singapour, le pourcentagedes travailleurs de la santé touchés était plus élevé, à 43 pour centet 41 pour cent, respectivement. La répartition par âge et par sexe desLe SRAS à Hong Kong est le suivant : 61,7 % des patients sontmoins de 45 ans, 21,2 % ont entre 45 et 64 ansd'âge et les autres ont plus de 64 ans. Onze(8,14 pour cent) des 135 premiers cas communautaires sans sontory de contact avec les patients du SRAS étaient de type zoonotique.Le taux de létalité à Hong Kong augmente avec l'âge comme dans d'autresrégions du monde : 14,7 % chez les moins de 44 ans, 21,4 %entre 45 et 64 ans, et 63,9 % plus de 64 ans. Expérience deHong Kong et d'autres régions suggèrent que les décès sontliés à des maladies coexistantes dans le groupe d'âge le plus avancé(>64 ans) [105].

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