Syndrome Respiratoire Aigu Sévère Coronavirus 2 Escape Mutants Et Immunité Protectrice Contre Les Infections Naturelles Ou Les Vaccinations
Mar 14, 2023
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Depuis la découverte de la nouvelle couronne, les gens ont accordé plus d'attention à l'amélioration de leur immunité, que ce soit par l'exercice ou la prise de suppléments. Parmi eux, nous avons constaté que les gens achetaient beaucoup de compléments alimentaires liés à Cistanche, qui est un complément alimentaire préservant la santé avec des effets importants de régulation et d'amélioration du système immunitaire. Il contient une variété d'ingrédients biologiquement actifs importants, tels que les polysaccharides, les saponines triterpéniques de ginseng, les flavonoïdes, etc. Ces ingrédients peuvent réguler le système immunitaire, améliorer la résistance immunitaire et renforcer la durabilité de l'immunité du corps lorsque celui-ci est attaqué par des agents pathogènes sexuels.
Le système immunitaire est le système immunitaire acquis du corps humain, principalement composé de cellules immunitaires et de molécules immunitaires, notamment les lymphocytes T, les lymphocytes B, les macrophages, les cellules tueuses naturelles, etc. Lorsque des agents pathogènes étrangers envahissent le corps humain, les cellules immunitaires et les molécules immunitaires travaillent ensemble à travers des interactions et une coopération complexes pour éliminer les agents pathogènes et protéger le corps. Il s'agit d'un processus complexe et délicat, dont le plus important est de réguler le système immunitaire pour assurer l'équilibre et la stabilité du système immunitaire, améliorant ainsi l'immunité et maintenant une bonne santé.
Le polysaccharide de Cistanche deserticola est un facteur immunorégulateur important, qui peut activer les macrophages, les cellules T et les cellules B, etc., améliorer la prolifération et l'activité des cellules immunitaires et améliorer l'immunité humaine. De plus, les flavonoïdes contenus dans Cistanche deserticola ont des effets anti-oxydants, anti-inflammatoires, antiviraux et autres, qui peuvent éliminer les radicaux libres et les substances étrangères dans le corps, réduisant ainsi la réponse inflammatoire du corps et le nombre d'infections, et améliorer l'immunité naturelle du corps et le niveau de base du système immunitaire.
En résumé, en tant qu'immunomodulateur, Cistanche possède d'importants ingrédients anti-tumoraux, anti-virus, anti-oxydants, anti-inflammatoires et autres actifs biologiques, qui peuvent renforcer la résistance du système immunitaire, améliorer l'immunité naturelle du corps humain et l'immunité durable du système immunitaire. sexe, réduisant ainsi l'incidence de diverses maladies. Dans l'environnement à haute pression et la pression de la vie de la société moderne, Cistanche est devenu un complément alimentaire important pour améliorer la qualité de vie et renforcer l'immunité du corps.
Introduction
Bien que les coronavirus aient des taux de mutation inférieurs à ceux des autres virus respiratoires à ARN, l'ampleur de la pandémie a mis l'importance de l'évolution virale des coronavirus sur le devant de la scène. On sait depuis longtemps que les coronavirus peuvent évoluer par l'acquisition de mutations et de recombinaisons, mais les connaissances dans le domaine sont loin derrière celles de certains autres virus à portée mondiale. Cette pandémie a vu une quantité sans précédent de séquençage génomique, qui commence à ouvrir un domaine de recherche entièrement nouveau : le suivi en temps réel des virus à l'échelle mondiale et la tentative de prédire quelles mutations et délétions peuvent être pertinentes.
Au cours de la diffusion mondiale et des longues chaînes de transmission, le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) s'est diversifié avec une accumulation de mutations. Beaucoup de ces mutations sont neutres, en ce sens qu'elles n'affectent aucune des propriétés du virus, certaines reflètent la dispersion géographique du virus (effets fondateurs), et certaines ont suscité des inquiétudes car elles peuvent permettre au virus d'échapper à l'immunité. générés en réponse à une infection antérieure ou améliorent la transmissibilité par des mécanismes encore indéfinis [1]. L'augmentation de l'immunité de la population par le biais d'infections naturelles et d'immunisations augmentera la pression de sélection sur le virus et augmentera probablement l'évolution de nouveaux mutants d'échappement. Cette brève revue examine les variants de virus et les mutations individuelles d'intérêt actuel, y compris les preuves de leur importance pour la transmission et la pathogénicité.
mutation
Il a été estimé que le SARS-CoV-2 évolue à un rythme de ~1,1 103 substitutions par site et par an, correspondant à une substitution tous les ~11 jours [2]. Les modifications de la protéine de pointe du SARS-CoV-2 peuvent modifier à la fois le récepteur de l'hôte et la liaison des anticorps avec des effets possibles sur l'infectiosité, le potentiel de transmission et la fuite des anticorps/vaccins. Si la pertinence des différents variants et de leurs combinaisons peut être appréciée in silico, leurs effets réels doivent être mesurés et vérifiés à la fois expérimentalement et par des enquêtes épidémiologiques. Plus de 12 000 mutations ont déjà été détectées dans la séquence SARS-CoV-2, par rapport à la séquence de référence décrite au début de l'épidémie à Wuhan (hCoV-19/Wuhan/WIV04/ 2019). Leurs effets sur l'aptitude virale, la transmissibilité ou les résultats cliniques sont encore largement inconnus. La surveillance des mutations a été mise en œuvre par différentes bases de données et plates-formes bioinformatiques, par exemple GISAID [3], les données ouvertes EU COVID-19 [4], la ressource NCBI SARS-CoV-2 [5], Prochaine souche [6], et le China Center for Bioinformation [7].
Il existe également maintenant trois systèmes de nomenclature, développés par Nextstrain [6], l'Université d'Edimbourg PANGO [8] et GISAID [3], respectivement, tous largement utilisés dans le domaine. Les mises à jour des détections de mutations du gène de pointe pour chaque clade GISAID sont publiées quotidiennement sur le site Web de CoVariants [3,9], ainsi que des cartes géographiques de leur distribution proportionnelle [10], et visualisées grâce à la collaboration avec NEXTSTRAIN. La version actuelle du logiciel de visualisation de données NEXT TRAIN permet de basculer entre les désignations de lignée GISAID et PANGO, et l'OMS travaille sur un système unificateur de nomenclature.
Trois lignées SARS-CoV-2 récemment détectées (B.1.1.7, B.1.351 et P.1) ont été examinées car elles sont inhabituellement divergentes et chacune possède une constellation unique de mutations d'importance biologique potentielle, plusieurs dont se trouvent dans le gène codant pour la protéine de pointe (tableau 1) [11e15]. De plus, certains génomes viraux de la lignée B.1.1.7 ont été observés et ont acquis la mutation E484K, qui serait liée à l'évasion immunitaire [15e17].
Liaison cellulaire et immunité fonctionnelle
On s'attend à ce que les mutations qui provoquent des changements conformationnels dans le domaine de liaison au récepteur de la protéine de pointe et qui affectent la liaison aux principaux récepteurs tissulaires de l'hôte aient un impact sur l'infectivité. Pour les variantes ci-dessus, il existe certaines preuves que l'affinité de liaison est augmentée et qu'il peut y avoir un avantage sélectif augmentant la transmissibilité. Une étude récente a tracé l'affinité de liaison à l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 de toutes les mutations du domaine de liaison au récepteur par rapport à leur incidence dans la population et a montré une forte corrélation entre les deux [18]. Il a également montré comment une évolution ultérieure pourrait augmenter l'affinité de liaison [19]. Ces mutations sont également considérées comme ayant l'impact le plus important sur les effets des anticorps neutralisants. Une étude a montré que la liaison par des anticorps sériques polyclonaux est affectée par des mutations dans trois épitopes principaux du domaine de liaison au récepteur [1].
Le site le plus important est E484, où la neutralisation par certains sérums de convalescents et de vaccinés est réduite de plus de dix fois par plusieurs mutations, dont une dans des lignées virales émergentes en Afrique du Sud (B.1.351, également appelée 501.V2) et au Brésil (B .1.1.28.1, également nommé P.1) [1,20]. Une étude utilisant le pseudovirus Varicella-Zoster (VSV) exprimant différentes variantes de la protéine de pointe SARS-CoV-2 a révélé que les pseudovirus VSV avec pointe contenant K417N-E484KeN501Y-D614G et les mutations complètes B.1.351 étaient moins facilement neutralisés avec 2. Titres d'anticorps neutralisants 7- et 6,4- fois inférieurs respectivement par rapport au pseudovirus VSV non variant utilisé dans cette étude [21].
Bien que certaines de ces observations soient préoccupantes, le domaine est très jeune et une évaluation minutieuse des effets est nécessaire, par exemple sur l'impact de l'émergence de variants sur l'efficacité des vaccins. En plus des anticorps neutralisants et liants, l'infection par le SARSCoV-2 suscite également un vaste répertoire de réponses des lymphocytes T et les épitopes dominants pourraient se lier à plusieurs variantes alléliques de l'antigène leucocytaire humain [22]. Une autre étude menée par les mêmes auteurs a révélé que «les réponses des lymphocytes T CD4þ et CD8þ chez les sujets convalescents COVID-19 [maladie à coronavirus 2019] ou les vaccinés à ARNm COVID-19 ne sont pas substantiellement affectées par les mutations trouvées dans le SRAS- CoV-2 variants' [23]. Une limite majeure de cette étude est que tous les donneurs ont été recrutés en Californie et n'avaient aucune exposition connue aux variantes d'évasion trouvées pour la première fois au Royaume-Uni, en Afrique du Sud ou au Brésil. Par conséquent, nous ne savons pas si les réponses des lymphocytes T provoquées par une infection antérieure par le SRAS-CoV -2 ou une immunisation avec les vaccins actuels de première génération seront protectrices contre les infections par des mutants d'échappement.
Variante sud-africaine B.1.351
La lignée B.1.351 est présente dans 90 % des infections récentes pour lesquelles des données de séquence ont été générées en Afrique du Sud et a été associée à une transmissibilité accrue [24]. Des articles de presse indiquent qu'il pourrait également prédominer au Botswana, au Zimbabwe, en Zambie, en Namibie et au Malawi [25]. Un nombre croissant de cas ont été détectés avec la variante B.1.351 dans différentes parties du Royaume-Uni, qui représenterait des cas de deuxième et troisième génération, car les personnes infectées n'avaient aucun lien connu avec l'Afrique du Sud [26] ; au moment de la rédaction de cet article, des variantes de virus B.1.351 ont été trouvées dans plus de 50 pays. Le vaccin Novavax COVID-9 s'est avéré un peu moins efficace pour prévenir l'infection dans un deuxième essai en Afrique du Sud, où la variante B.1.351 du SRAS-CoV-2 est répandue. Dans l'essai en Afrique du Sud sur plus de 4400 personnes, le vaccin était efficace à 60 % chez les personnes négatives pour le virus de l'immunodéficience humaine [27], contre 89,3 % pour prévenir le COVID-19 chez les participants à son essai clinique de phase 3 au Royaume-Uni [28]. L'efficacité protectrice a encore été réduite à 49,4 % chez les individus sud-africains infectés par le variant B.1.351 [25]. Dans un essai de phase 3 incluant 44 000 personnes, une dose unique de Johnson and Johnson, JNJ, le vaccin a montré une efficacité protectrice globale de 66 %.
Cependant, l'efficacité contrastée de 72 % dans le bras américain de l'essai contre 57 % en Afrique du Sud soutient le concept d'évasion immunitaire/résistance de la variante B.1.351, comme on le voit après le vaccin Novavax [29]. Une étude récente d'Afrique du Sud a révélé qu'une neutralisation efficace par des sérums immuns après des infections à B.1.351 inhibait le virus de la première vague (non B.1.351), fournissant des preuves préliminaires que les vaccins basés sur des séquences variantes pourraient fonctionner contre d'autres SARSCoV circulants-2 lignées [30]. Cependant, il reste à voir dans quelle mesure l'émergence de nouvelles variantes affecte l'efficacité du vaccin car les résultats d'essais séparés sont difficiles à comparer.
Variante brésilienne P.1
La lignée P.1 a été découverte pour la première fois à Manaus, au Brésil, où elle représentait 42% des génomes échantillonnés en décembre 2020, après avoir été absente des échantillons collectés là-bas entre mars et novembre 2020 [14]. Une étude brésilienne a révélé que 76 % de la population avait été infectée par le SARS-CoV-2 en octobre 2020 [31]. La forte augmentation du nombre d'admissions à l'hôpital COVID-19 observée à Manaus en janvier 2021 (3431 pour le 1e19 janvier 2021 contre 552 pour le 1e19 décembre 2020) indique que l'immunité obtenue lors de l'infection entre le milieu et la fin de 2020 n'était pas entièrement protecteur [32]. On sait peu de choses sur la transmissibilité de la lignée P.1, mais elle partage plusieurs mutations acquises indépendamment avec les lignées B.1.1.7 (N501Y) et B.1.325 (K417N/T, E484K, N501Y) détectées pour la première fois au Royaume-Uni. et l'Afrique du Sud, qui semblent avoir une transmissibilité accrue [13]. La variante a été détectée dans 25 pays.
Mises à jour des vaccins et avenir de la vaccination contre le SRAS-CoV-2
Moderna explore comment leur vaccin pourrait être mis à jour pour incorporer des séquences codant pour les nouvelles variantes de la protéine de pointe [33]. Novavax travaille sur un rappel et un vaccin bivalent combiné en réponse au variant B.1.351 en Afrique du Sud [34]. BioNTech cherche à autoriser une nouvelle version du vaccin PfizerBioNTech qui serait mieux à même de prévenir la variante en Afrique du Sud [25]. Les études estimant la capacité des vaccins à réduire la transmission des différentes lignées virales restent essentielles [35]. Un défi sera de savoir quand décider de changer la composition du vaccin, car la dispersion n'est pas uniforme à l'échelle mondiale. De plus, les régulateurs étudient le processus réglementaire nécessaire pour les mises à jour des vaccins.
Conclusion
L'expansion mondiale du SRAS-CoV-2 et la circulation continue dans les populations partiellement immunisées ont conduit à l'émergence de variantes avec certains changements adaptatifs conduisant à une transmissibilité accrue et/ou une sensibilité réduite aux anticorps neutralisants. Le nombre croissant de personnes immunisées contre le SRAS-CoV-2 à la suite d'une infection naturelle ou d'une vaccination, et l'inégalité d'accès et/ou d'application des interventions et des vaccins sont susceptibles de créer une pression immunitaire supplémentaire sur le virus. De ce fait, la stratégie des fabricants de vaccins d'anticiper le besoin de vaccins de deuxième génération couvrant les nouveaux mutants est rassurante. Du point de vue de la santé publique, nous aurons probablement besoin de cycles de vaccination répétés, comme ceux déjà en place pour la grippe, avec des vaccins annuels adaptés aux nouvelles variantes. Le défi avec le SRAS-CoV2 est l'échelle mondiale du besoin de vaccination.
Par conséquent, l'infrastructure de vaccination développée pour le présent programme devra probablement être maintenue. Pour avoir une perspective globale sur l'évolution du SRAS-CoV-2, l'augmentation de la capacité mondiale de surveillance virale est essentielle pour surveiller l'apparition et la propagation inévitables de nouvelles mutations dans différentes parties du monde. Cela inclut l'harmonisation de la nomenclature actuellement déroutante.
Déclaration de transparence
Les auteurs déclarent n'avoir aucun conflit d'intérêts. L'étude n'a reçu aucun financement.
Contributions des auteurs
Tous les auteurs ont contribué de manière égale au manuscrit.
Les références
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